故事发生在一个由神明辉夜兔创造的世界这个世界上存在着名为查克拉的魔法，普通人通过修行可以吸收查克拉，习得强大的忍术，成为具有移山倒海之力的强大忍者。由于这个世界里的人都长有一对兔耳，因此也被称作“兔忍”。这个世界因为盛行忍法也因此被称作“忍界”。具有全世界最强战力的兔忍被称作最强兔忍，这也是无数强者奋斗一生的目标。玩家作为木叶村的一名忍校学生，将成为最强兔忍和拯救世界作为自己的目标，和小伙伴们一同奋斗。